top of page

Logiciel de recherche open source

  • Construit en Python à l'aide de packages de l'écosystème Scientific Python et de la science des données

  • Emballé dans des sous-modules avec une interface Jupyter Notebook

  • Documenté, version contrôlée ; construit pour être compris et réutilisé

Exemple de projet : 

outil d'analyse de la plasticité cellulaire  (cellPLATO)

 

Un pipeline de traitement, d'analyse et de visualisation de données pour les données time-lapse d'une seule cellule.


Traits:

  • Mise en commun et comparaison d'expériences répétées à partir de plusieurs conditions.

  • Mesures de forme via SciKit-Image

  • Accepte l'entrée de résultat de suivi des cellules de Bayesian Tracker ou Usiigaci. 

  • Réduction de la dimensionnalité

  • Sortie graphique systématique pour les facteurs spécifiés par l'utilisateur

  • Interface conviviale de Jupyter Notebook pour interagir avec le package Python modulaire

  • Logiciel de recherche Open Source à version contrôlée, voir project hébergé sur Github.

​



 

bottom of page