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Quorumetrix
Conception axée sur les données
Logiciel de recherche open source
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Construit en Python à l'aide de packages de l'écosystème Scientific Python et de la science des données
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Emballé dans des sous-modules avec une interface Jupyter Notebook
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Documenté, version contrôlée ; construit pour être compris et réutilisé
Exemple de projet :
outil d'analyse de la plasticité cellulaire (cellPLATO)
Un pipeline de traitement, d'analyse et de visualisation de données pour les données time-lapse d'une seule cellule.
Traits:
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Mise en commun et comparaison d'expériences répétées à partir de plusieurs conditions.
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Mesures de forme via SciKit-Image
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Accepte l'entrée de résultat de suivi des cellules de Bayesian Tracker ou Usiigaci.
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Réduction de la dimensionnalité
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Sortie graphique systématique pour les facteurs spécifiés par l'utilisateur
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Interface conviviale de Jupyter Notebook pour interagir avec le package Python modulaire
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Logiciel de recherche Open Source à version contrôlée, voir project hébergé sur Github.
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